成功在伺服器上建立主人用戶後，客戶端會從伺服器上運載起動。
如您正使用PXE起動程式，在正常運作的情況下客戶端會看到一個起動目錄。如正使用 Etherboot，您會立即看到一個起動目錄。在起動見錄中會有兩個選擇，第一個是起動 Aptus，第二個是起動 local。您可以按[ L ] 回到地方媒體進行雙起動。 如您沒有作出任何按動及指令，Aptus 會在3秒後到時，您將需要重新運載 Linux 核心及起動 Linux。
在首次啟動時，客戶端會起動一個全新的 Linux 作業系統。由於偵測到新的硬件，硬件偵測體會提示您進行硬件配置。由於 Aptus 配置器已完成所有網絡配置，您無需再進行手動設定及配置。當硬件偵測體詢問是否遷移您的現有配置，請回答是。
由於所有文件，包括配置文件都是可以共用的，這表示除了網絡及硬件配置外，所有其他 Linux 作業平台的配置均和伺服器一樣。如您想自行編寫客戶端的配置，您可以以根用戶登入客戶端進行預設配置,或在客戶控製台進行配置。每個客戶端均會在複製到 Webmin 伺服器上，您可以連接到 Webmin 伺服器進行配置。您更可以使用您喜歡的配置工具如 "Xconfigurator" 去配置 Redhat Linux 上的 Xfree86，或是在 Mandrake Linux 上使用 "Xdrake"；大部份工具都可以正常運作的。 另外，您亦可以修改配置文件，如文件位於根文件系統中的"/"被客戶端修改，那只會對該台客戶端構成影響。被修改的配置仍會存放在伺服器中的主人用戶目錄中 /var/opt/aptus/mygroup/hosts/myhost。