成功在伺服器上建立主人用户後，客户端会从伺服器上运载起动。
如您正使用PXE起动程式，在正常运作的情况下客户端会看到一个起动目录。如正使用 Etherboot，您会立即看到一个起动目录。在起动见录中会有两个选择，第一个是起动 Aptus，第二个是起动 local。您可以按[ L ] 回到地方媒体进行双起动。 如您没有作出任何按动及指令，Aptus 会在3秒後到时，您将需要重新运载 Linux 核心及起动 Linux。
在首次启动时，客户端会起动一个全新的 Linux 作业系统。由於侦测到新的硬件，硬件侦测体会提示您进行硬件配置。由於 Aptus 配置器已完成所有网络配置，您无需再进行手动设定及配置。当硬件侦测体询问是否迁移您的现有配置，请回答是。
由於所有文件，包括配置文件都是可以共用的，这表示除了网络及硬件配置外，所有其他 Linux 作业平台的配置均和伺服器一样。如您想自行编写客户端的配置，您可以以根用户登入客户端进行预设配置,或在客户控制台进行配置。每个客户端均会在复制到 Webmin 伺服器上，您可以连接到 Webmin 伺服器进行配置。您更可以使用您喜欢的配置工具如 "Xconfigurator" 去配置 Redhat Linux 上的 Xfree86，或是在 Mandrake Linux 上使用 "Xdrake"；大部份工具都可以正常运作的。 另外，您亦可以修改配置文件，如文件位於根文件系统中的"/"被客户端修改，那只会对该台客户端构成影响。被修改的配置仍会存放在伺服器中的主人用户目录中 /var/opt/aptus/mygroup/hosts/myhost。